Program S2 Informatika Universitas Atma Jaya Yogyakarta (S2 INFORMATIKA – UAJY) diselenggarakan untuk memenuhi kebutuhan pasar akan tenaga profesional dalam bidang Tekni Informatika dan Sistem informasi diIndonesia khususnya dan Internasional umumnya. Pasar tenaga kerja tersebut diantaranya adalah manajer Information and Communication Technology (ICT) di dunia industri (broadcasting TV, manufaktur, software house, perbankan, periklanan, multimedia, dll), pendidik, peneliti, praktisi, konsultan, pelaku industri, dan lain sebagainya.
Saat ini, S2 Informatika memiliki tiga kosentrasi yaitu Intelligent Informatics, Innovation of Computational Science dan Information Technology Management. Program Studi S2 Informatika menerima mahasiswa baru pada tiap semester yaitu Gasal dan Genap. Informasi terkait pendaftaran mahasiswa baru dapat dilihat pada link berikut: https://pmb.uajy.ac.id/Home/InfoS2