Kurikulum S2 INFORMATIKA-UAJY dirancang untuk dapat diselesaikan dalam jangka waktu 3 semester atau 1,5 th dan menyelesaikan minimum 36 SKS. Mahasiswa minimal harus mengambil matakuliah wajib 15 SKS, matakuliah peminatan 6 SKS, matakuliah pilihan bebas 9 SKS dan tesis 6 SKS.
Adapun struktur lengkap Kurikulum OBE S2 INF UAJY 2021 dapat dilihat pada tabel 10.
Tabel 10. Struktur Kurikulum OBE S2 INF UAJY 2021
| MATAKULIAH WAJIB | |||||
| No | Kode MK | Mata Kuliah (MK) | Semester | Bobot sks | |
| 1 | MINF01103 | Studi Mandiri | 1 | 3 | |
| 2 | MINF 02103 | Kecerdasan Komputasional | 1 | 3 | |
| 3 | MINF 03103 | Pengembangan Piranti Bergerak | 1 | 3 | |
| 4 | MINF04103 | Sistem Informasi Korporat | 1 | 3 | |
| 5 | MINF05203 | Metodologi Penelitian | 2 | 3 | |
| 6 | MINF06306 | Tesis | 3 | 6 | |
| Jumlah | 21 | ||||
| MATAKULIAH PILIHAN KONSENTRASI | ||||
| No | Kode MK | Mata Kuliah (MK) | Semester | Bobot sks |
| Intelligent Informatics | ||||
| 1 | MINF07103 | Sistem Cerdas | 2 | 3 |
| 2 | MINF08203 | Sistem Berbasis Pengetahuan | 2 | 3 |
| 3 | MINF09203 | Big Data dan Machine Learning | 1 | 3 |
| Innovation of Computational Science | ||||
| 1 | MINF10103 | Interaksi Manusia dan Komputer Lanjut | 1 | 3 |
| 2 | MINF11203 | Multimedia Cerdas | 2 | 3 |
| 3 | MINF12203 | Pemrosesan Paralel | 2 | 3 |
| Information Technology Management | ||||
| 1 | MINF13103 | E-Business | 1 | 3 |
| 2 | MINF14203 | Tata Kelola Teknologi Informasi | 2 | 3 |
| 3 | MINF15203 | Teori Adopsi dan Penerimaan Teknologi | 2 | 3 |
| MATAKULIAH PILIHAN BEBAS | ||||
| No | Kode MK | Mata Kuliah (MK) | Semester | Bobot sks |
| 1 | MINF16203 | Komputasi Numerik | 2 | 3 |
| 2 | MINF17203 | Gamification | 2 | 3 |
| 3 | MINF18203 | Riset kuantitatif pada teknologi Informasi | 2 | 3 |
| 4 | MINF19203 | Pemodelan dan Simulasi | 2 | 3 |
| 5 | MINF20203 | Rekayasa Perangkat Lunak Lanjut | 2 | 3 |
| 6 | MINF21203 | Teknologi Informasi dalam Tata Pemerintahan | 2 | 3 |
| 7 | MINF22203 | Pengolahan Citra | 2 | 3 |
| 8 | MINF23203 | Desain Inovasi dan Sistem Informasi | 2 | 3 |
| 9 | MINF24203 | Kapita Selekta | 2 | 3 |