Program Studi Sistem Informasi memiliki berbagai fasilitas yang dapat digunakan untuk berbagai keperluan mahasiswa dan dosen. Fasilitas-fasilitas tersebut terdiri dari sarana dan prasarana antara lain:
- Ruang Kelas yang dilengkapi dengan meja, LCD, papan tulis (whiteboard), Air Conditioner (AC), fingerprint, dan akses internet melalui Wi-Fi.
- Laboratorium Rekayasa Proses Bisnis (RPB)
- Laboratorium Inovasi Teknologi dan Sistem Informasi (ITSI)
- Ruang Video Conference yang disediakan dan dikelola oleh Kantor Sistem Informasi
- Gazebo dan meja kursi untuk diskusi
- Perpustakaan UAJY dengan koleksi yang lengkap dan sudah terakreditasi “A”
- Staf pengajar minimal bergelar Master dari Universitas ternama baik dari dalam maupun luar negeri dan sudah berpengalaman di bidangnya
- Program Bahasa dan Budaya yang diselenggarakan oleh KPBB seperti Jogja Istimewa dan Cross Cultural Understanding (CCU)
- Program Pengembangan diri yang diselenggarakan oleh KKACM
- Kesempatan mengembangkan diri dan mengasah hardskill dan softskill dalam Unit Kegiatan Mahasiswa, Komunitas UAJY, dan berbagai Himpunan Mahasiswa khususnya HIMSI (Himpunan Mahasiswa Sistem Informasi.)
- Auditorium
- Sport Hall
- Klinik Universitas
- Bookshop
- Kantin
- ATM
- Bank
- Parkir