Laboratorium metrologi (kalibrasi) berada di samping ruang Kepala Laboratorium, digunakan untuk melakukan kalibrasi alat ukur, seperti vernier caliper dan mikrometer sekrup. Saat ini, laboratorium membuka jasa kalibrasi alat-alat ukur tersebut. Kalibrasi dilakukan oleh kalibrator yang memiliki sertifikat kalibrator dari LIPI.